Program Studi Pendidikan Biologi merupakan salah satu Program Studi dalam lingkungan Fakultas Keguruan Dan Ilmu Pendidikan Universitas Pattimura yang didirikan berdasarkan Surat Keputusan Direktorat Jenderal Pendidikan Tinggi Nomor 105/DIKTI/Kep/1984 tertanggal 21 Agustus 1984. Sebagai tindak lanjut Surat keputusan tersebut, maka dikeluarkan Surat Keputusan Izin Penyelenggaraan Nomor 238/DIKTI/Kep/1996 tertanggal 11 Juli Tahun 1996. Pada tahun 2010, Program Studi Pendidikan Biologi telah diakreditasi oleh Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi dan memperoleh peringkat B dengan nilai 303 berdasarkan SK Nomor : 022/BAN-PT/Ak-XIII/S1/X/2010. Kemudian pada tahun 2015 memperoleh peringkat “B”dengan nilai 334 sesuai SK No. 1155/SK/BAN-PT/Akred/S/XI/2015.